Sadržaj

• Pregled softvera
• Podržane vrste datoteka
• Primarno proširenje datoteke
• Ostale ekstenzije datoteka koje koristi Integrated Genome Browser 9

Verzija (od 29.6.2016.)	9
platforme
licenca	Otvoreni izvor
Kategorija	znanstveni

Više informacija (posjetite web-lokaciju izdavača)

Ocjena: 2.8 / 5 (6 glasova)

Pregled softvera

Glavne značajke

• Podržava različite formate genoma kao što su GenBank i FASTA
• Interakcija s podacima pomoću animacije za zumiranje i pomicanje
• Pristupite i učitajte genome s web-lokacija QuickLoad
• Pretvorite podatke u različite oblike grafikona
• Podijelite podatke s suradnicima putem Dropboxa
• Instalirajte dodatke za dodatnu funkcionalnost

Integrirani preglednik genoma (IGB) je program otvorenog koda koji se koristi za pregled i istraživanje velikih genomskih skupova podataka. Možete pregledavati različite formate podataka, komunicirati s vašim podacima, stvarati grafikone, spremati podatke kao slike i dijeliti podatke s suradnicima.

IGB vam omogućuje pregled podataka iz bilješki i poravnanih sekvenci. Program podržava različite formate kao što su FASTA, BAM, BEDGRAPH, BigWIG, Cytoband i GenBank. Možete uzeti podatke i pretvoriti ih u različite oblike grafikona uključujući grafikone neusklađenosti za isticanje razlika u podacima i grafikone dubine za prikaz pokrivenosti. Također možete komunicirati sa svojim podacima pomoću IGB-ovih animacija za zumiranje i pomicanje.

IGB vam omogućuje pristup i učitavanje genoma s web-mjesta QuickLoad, koji su jednostavni sustavi direktorija, sekvenci i drugih podatkovnih datoteka za potrebe vizualizacije. IGB pruža naprednu funkcionalnost s podrškom za dodatke za dodavanje funkcionalnosti i automatizaciju rada pomoću skripti. IGB vam također pruža napredne značajke za dijeljenje podataka, bilo da se radi o objavljivanju u visokokvalitetnoj JPEG, PNG ili SVG slici ili pohranjivanju podataka u Dropboxu kako bi suradnicima omogućili pristup vašem projektu.

IGB prvenstveno koriste sveučilišni istraživači, biolozi i bioinformatičari. Pruža napredne alate za otvaranje raznih formata podataka genoma, vizualizaciju podataka kao različitih grafova i dijeljenje podataka sa suradnicima. Nažalost, program se oslanja na bespovratna sredstva za kontinuirani razvoj, što znači da bi potpora za prijavu mogla prestati u bilo kojem trenutku. Međutim, Integrated Genome Browser je još uvijek sposoban, prilagodljiv program za korisnike koji žele istražiti i analizirati svoje podatke o genomu.

Podržane vrste datoteka

Primarno proširenje datoteke

.XML - XML ​​datoteka

Ostale ekstenzije datoteka koje koristi Integrated Genome Browser 9

Podržane vrste datoteka
.KREVET	Datoteka zapisa napomena UCSC BED-a
.DAS	Sjednica analize DeltaMastera
.FA	FASTA formatirana sekvencijska datoteka
.FAS	FASTA sekvencijska datoteka
.FASTA	FASTA sekvencijska datoteka
.GB	GenBank podatkovna datoteka
.SGR	SGR Genome Data File
.USEQ	USeq Genome Data File